进口货物入关时货主必须亲自到海关履行货物申请报手续或委托代理人交换票据（海关管理局的进口许可证必须按时递交）办理，总的船货（包括茶叶和烟草）允许免费保存8天，超过8天应交纳滞期费，滞期费用自然增长。在3个月后无人认领的货物由海关公开拍卖。在免费保存的8天期间内，可以将货物存入国营或私营的尚未完税的仓库或者运入简易冷藏库，货物在这些仓库可以保存6个月。
二、进口单证
1、商业发票：必须具备原始发票并得到埃及领事馆法律上的认可，若有信用证明则不需要法律上的认可。
2、估价单：进口商提交进口申请许可证（如果需要进口许可证）时，进口商需要呈进口商品的估价单，还要注明货物的生产国。
3、提货单：应写明发货人的姓名、收货人的姓名和地址、指定的卸货港口和商品说明书、货物的一览表，提货单的编码一定要全部登记。
4、放射证书：许多农副产品的进口，在到达港口时都要接受不定期的检查，同时还需要该产品的说明书，说明书应证明该产品没有受到放射性污染。
三、进口管制
埃及对外经济贸易部有一份禁止进口的商品清单，只要不在此清单的商品都可以自由进口。清单中包括：纺织品、成衣和家禽。埃及对外经济贸易部还负责制定长期的外贸政策和准备每年的具体进口商品的计划。私营部门进口商品的外汇支付是通过商业银行的许可和进口商自己的外汇来源。另外，对非出售的货物样品或价值广告品，如目录、商品价目表和幻灯片可免税入关。
四、进口关税
埃及的基本进口商品的关税率5%-50%，但不包括奢侈商品的关税率。奢侈商品包括香烟、酒类和发动机超过1300CC的小汽车等的海关税率可高达150%。关税可用埃及镑支付。埃及采用从价税来征收进口关税。一般来说，若进口商品的发票价格与其固定售价相符合，发票价格作为征收其关税的基础，这个固定售价根据此类货物第一次进口的发票价而确定，如若发票价低于固定销售价，而海关价值就是固定销售价，这样进口商必须对发票外的差价补交关税。如果进口商品的发票金额小于商品的实际价值，对于陷瞒商品价值的余额征收商品发票金额的10%-100%的罚金。
五、进口包装
商品的包装必须经受得住粗暴的装卸，太阳的暴晒，高湿度包装箱应该是里、外都防水的包装箱，并用双铁皮捆住。要制的包装箱运输到埃及港口，必须进行事先处理，并在箱内有杀菌的产品，木制包装箱进行熏蒸和烟熏杀虫。若木制包装箱被发现木材害虫，埃及海关将予以扣留。
六、自由港和自由贸易区
埃及已开放的自由港有：塞得港、亚历山大港、苏伊士港。埃及的这些自由港均设立了管理委员会，管理委员会下设了各种机构，如税收机构、投资机构、贸易机构、安全保险机构、服务机构等。塞得港设立的免税区中，商品可以自由出入，不必交纳手续费。埃及的自由贸易区分为两类，一类是由中央政府管理的自由贸易区，另一类是由当地政府控制的国营的自由贸易区。国家开放的自由贸易区有：苏伊士城（塔菲克港口区）、塞得港、埃及政府宣布整个塞得港城为自由贸易区、亚历山大（阿尔·阿迈苏尔区）、伊斯梅利亚城和靠近开罗的内赛尔城和正在建设中的迪来亚特自由港。在自由贸易区进行经营活动需要埃及政府批准和许可证书。
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